############################################################################### ## NEWS to package MKomics ############################################################################### ########################################################### ## Version 0.7 ########################################################### - added new versions of corPlot, simPlot and madPlot based on package ComplexHeatmap - adapted links http -> https ########################################################### ## Version 0.6 ########################################################### - removed some unnecessary changes of graphical parameters. ########################################################### ## Version 0.5 ########################################################### - resetting old graphics parameters with no.readonly = TRUE - mod.t.test gained argument na.rm for computing group means ########################################################### ## Version 0.4 ########################################################### - Removed (orphaned) package 'gplots' from suggests field, use standard heatmap function from packages 'stats' instead ########################################################### ## Version 0.3 ########################################################### - Added on.exit calls to simPlot, corPlot and madPlot ########################################################### ## Version 0.2 ########################################################### - Changed computations in case of paired moderated t test. - Added moderated repeated-measures one-way ANOVA to mod.oneway.test ########################################################### ## Version 0.1 ########################################################### - Start of development - Copied functions corDist, corPlot, heatmapCol, madMatrix, madPlot, mod.t.test, mod.oneway.test, oneWayAnova, pairwise.logfc, pairwise.fc, pairwise.mod.t.test, repMeans, simPlot, stringDist, stringSim, traceBack, twoWayAnova from package MKmisc